Protein–RNA interactions for Protein: Q12293

TY2A-OR2, Transposon Ty2-OR2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR2Q12293 YBR116CYBR116C 528 nt4.06□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 ERV15YBR210W 429 nt4.06□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 POF1YCL047C 777 nt4.06□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 SEC59YMR013C 1560 nt4.06□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 ATP16YDL004W 483 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 FCF1YDR339C 570 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YDR535CYDR535C 501 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 BNA6YFR047C 888 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YGL132WYGL132W 336 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 SPO11YHL022C 1197 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YHI9YHR029C 885 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YIL171WYIL171W 330 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YNL057WYNL057W 333 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 TRM112YNR046W 408 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 snR189snR189 189 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YPR174CYPR174C 666 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YBR242WYBR242W 717 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YPL260WYPL260W 1656 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 RDH54YBR073W 2877 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YCR023CYCR023C 1836 nt4.05□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YBR238CYBR238C 2196 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 VBA2YBR293W 1425 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 MGA1YGR249W 1371 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 SPT14YPL175W 1359 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 GDH2YDL215C 3279 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 OCA4YCR095C 1089 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 LSM4YER112W 564 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 RAD27YKL113C 1149 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 SMD2YLR275W 333 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 URA5YML106W 681 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 CSM3YMR048W 954 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 GRX5YPL059W 453 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 DIM1YPL266W 957 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 AZR1YGR224W 1842 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 NTH1YDR001C 2256 nt4.04□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 KRE28YDR532C 1158 nt4.03□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 RSM25YIL093C 795 nt4.03□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 YMR310CYMR310C 954 nt4.03□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 TAZ1YPR140W 1146 nt4.03□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 RAD54YGL163C 2697 nt4.03□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 TRF5YNL299W 1929 nt4.03□□□□□ -1.76
TY2A-OR2Q12293 TRM11YOL124C 1302 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 LAS1YKR063C 1509 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 DSE1YER124C 1722 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 RPS25AYGR027C 327 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 PET130YJL023C 1044 nt4.02□□□□□ -1.77
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TY2A-OR2Q12293 END3YNL084C 1050 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 MRPL17YNL252C 846 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 FIG1YBR040W 897 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 IDI1YPL117C 867 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 POP4YBR257W 840 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 FLO8YER109C 2400 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 YPL109CYPL109C 1974 nt4.02□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 OLE1YGL055W 1533 nt4.01□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 SPI1YER150W 447 nt4.01□□□□□ -1.77
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TY2A-OR2Q12293 YNL320WYNL320W 855 nt4.01□□□□□ -1.77
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TY2A-OR2Q12293 RNA14YMR061W 2034 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 ISW2YOR304W 3363 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 LYS2YBR115C 4179 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 RPP1AYDL081C 321 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 API2YDR525W 330 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 EFB1YAL003W 621 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 RDN5-1RDN5-1 121 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 RDN5-6RDN5-6 121 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 YLR428CYLR428C 345 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 RPL15BYMR121C 615 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 DLT1YMR126C 1029 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 YNL303WYNL303W 348 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 YPR078CYPR078C 1119 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 YML020WYML020W 1995 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 UBP12YJL197W 3765 nt4□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 EPO1YMR124W 2832 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 PRP28YDR243C 1767 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 ACK1YDL203C 1872 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 GRC3YLL035W 1899 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 RPG1YBR079C 2895 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 THI13YDL244W 1023 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 THI11YJR156C 1023 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 SSO2YMR183C 888 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 snR11snR11 258 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 RSC3YDR303C 2658 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 SPC105YGL093W 2754 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 FDC1YDR539W 1512 nt3.99□□□□□ -1.77
TY2A-OR2Q12293 FRT2YAL028W 1587 nt3.98□□□□□ -1.77
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