Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 ARG5,6YER069W 2592 nt4.03□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 STU1YBL034C 4542 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 MIT1YEL007W 2001 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YJR030CYJR030C 2238 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 TCB3YML072C 4638 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 TRM1YDR120C 1713 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YDL186WYDL186W 834 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 BUD26YDR241W 288 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 MSW1YDR268W 1140 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 PIB1YDR313C 861 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YDR391CYDR391C 699 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YAL004WYAL004W 648 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YAL069WYAL069W 315 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 GCD7YLR291C 1146 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 MDM10YAL010C 1482 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 RTG3YBL103C 1461 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 GZF3YJL110C 1656 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 STV1YMR054W 2673 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 REB1YBR049C 2433 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YEL025CYEL025C 3567 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 ARX1YDR101C 1782 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 APP1YNL094W 1764 nt4.02□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 RTK1YDL025C 1863 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 NAM9YNL137C 1461 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 TEC1YBR083W 1461 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 RRP8YDR083W 1179 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 PUG1YER185W 912 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 ALB1YJL122W 528 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YLR042CYLR042C 486 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 NUP60YAR002W 1620 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 STU2YLR045C 2667 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 RNT1YMR239C 1416 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YTA7YGR270W 4140 nt4.01□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 TSR1YDL060W 2367 nt4□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 CTH1YDR151C 978 nt4□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 TAF10YDR167W 621 nt4□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 MIG3YER028C 1185 nt4□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 REE1YJL217W 597 nt4□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 snR37snR37 386 nt4□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 BCH2YKR027W 2298 nt4□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 SHR3YDL212W 633 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 COX3Q0275 810 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 AIM22YJL046W 1230 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 SAW1YAL027W 786 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 BAT2YJR148W 1131 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 POP8YBL018C 402 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YBL096CYBL096C 309 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YOL162WYOL162W 648 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 APL4YPR029C 2499 nt3.99□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YFR045WYFR045W 930 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 CNN1YFR046C 1086 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 ECM34YHL043W 513 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YIL025CYIL025C 375 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 NEJ1YLR265C 1029 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 EAF7YNL136W 1278 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 ATG8YBL078C 354 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 SSU72YNL222W 621 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 RIB4YOL143C 510 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 SUT2YPR009W 807 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 CSR2YPR030W 3366 nt3.98□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 PUF2YPR042C 3228 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YLR345WYLR345W 1530 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 SYF1YDR416W 2580 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 COP1YDL145C 3606 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YCL068CYCL068C 783 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 GIC2YDR309C 1152 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 RPL30YGL030W 318 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 UTP11YKL099C 753 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 GAB1YLR459W 1185 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 RET3YPL010W 570 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 FDH2YPL275W 711 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 CSH1YBR161W 1131 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.97□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 ERB1YMR049C 2424 nt3.96□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 MDN1YLR106C 14733 nt3.96□□□□□ -1.77
LSP1Q12230 MGR3YMR115W 1506 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 EMC1YCL045C 2283 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YDR431WYDR431W 312 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 BMH1YER177W 804 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 PRX1YBL064C 786 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 TPM1YNL079C 600 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YOL118CYOL118C 309 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 CYC2YOR037W 1101 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 UGA3YDL170W 1587 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 SIZ1YDR409W 2715 nt3.96□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 DBP5YOR046C 1449 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 SSL1YLR005W 1386 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YCR099CYCR099C 468 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YGR126WYGR126W 693 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YJR071WYJR071W 369 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 USB1YLR132C 873 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YAR070CYAR070C 300 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 BTS1YPL069C 1008 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 POC4YPL144W 447 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 DIB1YPR082C 432 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 SPP381YBR152W 876 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 FLO5YHR211W 3228 nt3.95□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 GPI13YLL031C 3054 nt3.94□□□□□ -1.78
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