Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 FLC1YPL221W 2382 nt4.04□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 TPA1YER049W 1935 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 SPT14YPL175W 1359 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 SPB4YFL002C 1821 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 YCL068CYCL068C 783 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 ELO2YCR034W 1044 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 HMRA1YCR097W 381 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 RDI1YDL135C 609 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 snR83snR83 306 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 SPC19YDR201W 498 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 PRE9YGR135W 777 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 YKL162CYKL162C 1209 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 ASC1YMR116C 960 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 ATG34YOL083W 1239 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 TIF4632YGL049C 2745 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 SSH1YBR283C 1473 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 BUD5YCR038C 1929 nt4.03□□□□□ -1.76
UBX3Q12229 YFL040WYFL040W 1623 nt4.03□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SPC105YGL093W 2754 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 BUD6YLR319C 2367 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 NOP6YDL213C 678 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YDR220CYDR220C 294 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RSM27YGR215W 333 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SOL3YHR163W 750 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 FMC1YIL098C 468 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 VPS25YJR102C 609 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 PAM18YLR008C 507 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 REC102YLR329W 795 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 MRPL3YMR024W 1173 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 CCL1YPR025C 1182 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 ICS2YBR157C 768 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 GAT2YMR136W 1683 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RIM21YNL294C 1602 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 FRT2YAL028W 1587 nt4.02□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SMF1YOL122C 1728 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 FDC1YDR539W 1512 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YNR066CYNR066C 1311 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 NBP2YDR162C 711 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 LSB1YGR136W 726 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 PCL7YIL050W 858 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 BNA1YJR025C 534 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YKR051WYKR051W 1257 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 REH1YLR387C 1299 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YLR428CYLR428C 345 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 TEM1YML064C 738 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YMR130WYMR130W 909 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 TYE7YOR344C 876 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 BMT2YBR141C 1014 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YPK9YOR291W 4419 nt4.01□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 KTR6YPL053C 1341 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YDL228CYDL228C 642 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 ISC10YER180C 804 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YGL204CYGL204C 306 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPL24BYGR148C 468 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPL8AYHL033C 771 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 AIM18YHR198C 966 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPS4BYHR203C 786 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 IST3YIR005W 447 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPS4AYJR145C 786 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 ISA1YLL027W 753 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 EOS1YNL080C 1101 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YBR053CYBR053C 1077 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YBR063CYBR063C 1215 nt4□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SRP72YPL210C 1923 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPN9YDR427W 1182 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 COX6YHR051W 447 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YJL028WYJL028W 336 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 FOL3YMR113W 1284 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 PRX1YBL064C 786 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 MDM12YOL009C 816 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YOR169CYOR169C 465 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YBR287WYBR287W 1284 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YPL260WYPL260W 1656 nt3.99□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 POL31YJR006W 1464 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SEC2YNL272C 2280 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 TMA17YDL110C 453 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RAV2YDR202C 1056 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YGL214WYGL214W 486 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YJR038CYJR038C 363 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 FIP1YJR093C 984 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPL18BYNL301C 561 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPC34YNR003C 954 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 FRM2YCL026C-A 582 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 OSH2YDL019C 3852 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 GRC3YLL035W 1899 nt3.98□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 RPN4YDL020C 1596 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SAG1YJR004C 1953 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 HSP42YDR171W 1128 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SRB7YDR308C 423 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 IRC22YEL001C 678 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YGL117WYGL117W 798 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 PRP18YGR006W 756 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 YBL010CYBL010C 843 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 SIW14YNL032W 846 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 VPS45YGL095C 1734 nt3.97□□□□□ -1.77
UBX3Q12229 GCD1YOR260W 1737 nt3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.7 ms