Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIPAL4Q0D2K0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms