Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP3CAQ08209 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP3CAQ08209 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms