Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOXM1Q08050 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXM1Q08050 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms