Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL16A1Q07092 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL16A1Q07092 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL16A1Q07092 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms