Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 SPS2YDR522C 1509 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 LAS1YKR063C 1509 nt3.78□□□□□ -1.8
SSK1Q07084 CDC14YFR028C 1656 nt3.78□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 UGA3YDL170W 1587 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 PHO13YDL236W 939 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RPC11YDR045C 333 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 ATP5YDR298C 639 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YFL051CYFL051C 483 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 EST3YIL009C-A 546 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YNL057WYNL057W 333 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 ICY2YPL250C 411 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 CBP6YBR120C 489 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 SSH4YKL124W 1740 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 BCK2YER167W 2556 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 FAA1YOR317W 2103 nt3.77□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YIG1YPL201C 1386 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 VMA1YDL185W 3216 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 GLO3YER122C 1482 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 ATP16YDL004W 483 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RXT3YDL076C 885 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YDR535CYDR535C 501 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 CWC23YGL128C 852 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 GTF1YGR102C 552 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RSM27YGR215W 333 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 CAB2YIL083C 1098 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RPL14AYKL006W 417 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 NKP2YLR315W 462 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 TRI1YMR233W 681 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 PSF3YOL146W 585 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 HSH49YOR319W 642 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 USV1YPL230W 1176 nt3.76□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RTS1YOR014W 2274 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 NUR1YDL089W 1455 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 BTN2YGR142W 1233 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 FMC1YIL098C 468 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 GTT1YIR038C 705 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 MED11YMR112C 396 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 SRL4YPL033C 846 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 DIM1YPL266W 957 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 ATP20YPR020W 348 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 GLN4YOR168W 2430 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 SYF1YDR416W 2580 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 SRS2YJL092W 3525 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 STV1YMR054W 2673 nt3.75□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 SRP72YPL210C 1923 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 UBC5YDR059C 447 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RPN9YDR427W 1182 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 IZH1YDR492W 951 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 SLI1YGR212W 1407 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YJL032WYJL032W 315 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YJR128WYJR128W 360 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 AUR1YKL004W 1206 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 SAM37YMR060C 984 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 IBD2YNL164C 1056 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RGS2YOR107W 930 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 snR37snR37 386 nt3.74□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 OSH2YDL019C 3852 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RPB2YOR151C 3675 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RSC3YDR303C 2658 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 DBP3YGL078C 1572 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 MTR10YOR160W 2919 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 TRK1YJL129C 3708 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 AZR1YGR224W 1842 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 GPM2YDL021W 936 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 GCD14YJL125C 1152 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 MET14YKL001C 609 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 PIR3YKL163W 978 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YLL037WYLL037W 381 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 PCD1YLR151C 1023 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 FMP41YNL168C 780 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 PEP4YPL154C 1218 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 MCM16YPR046W 546 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 STP22YCL008C 1158 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 AIM14YGL160W 1713 nt3.73□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 LYP1YNL268W 1836 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YEL010WYEL010W 351 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 LSM4YER112W 564 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 COX6YHR051W 447 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 CAP2YIL034C 864 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YAL065CYAL065C 387 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 AHP1YLR109W 531 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 RPL15BYMR121C 615 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 FSH3YOR280C 801 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 YAR1YPL239W 603 nt3.72□□□□□ -1.81
SSK1Q07084 NHP10YDL002C 612 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YEA4YEL004W 1029 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 UBC8YEL012W 657 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ERV29YGR284C 933 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 BAT2YJR148W 1131 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 SFH1YLR321C 1281 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 ASC1YMR116C 960 nt3.71□□□□□ -1.82
SSK1Q07084 YPL278CYPL278C 303 nt3.71□□□□□ -1.82
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