Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP4Q07065 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms