Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD51Q06609 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAD51Q06609 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms