Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN11Q06124 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN11Q06124 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms