Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTDSPL2Q05D32 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTDSPL2Q05D32 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms