Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNP2Q05952 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms