Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIN1Q05586 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms