Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN12Q05209 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN12Q05209 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms