Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3AQ05086 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3AQ05086 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms