Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN1Q04323 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN1Q04323 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBXN1Q04323 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms