Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAP1Q03518 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAP1Q03518 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms