Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TOP2BQ02880 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms