Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ID3Q02535 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ID3Q02535 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ID3Q02535 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ID3Q02535 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ID3Q02535 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ID3Q02535 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ID3Q02535 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ID3Q02535 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms