Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPEQ02224 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPEQ02224 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms