Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
XPCQ01831 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPCQ01831 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPCQ01831 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPCQ01831 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPCQ01831 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XPCQ01831 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XPCQ01831 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XPCQ01831 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
XPCQ01831 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
XPCQ01831 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XPCQ01831 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPCQ01831 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPCQ01831 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPCQ01831 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XPCQ01831 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XPCQ01831 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPCQ01831 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XPCQ01831 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XPCQ01831 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XPCQ01831 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XPCQ01831 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XPCQ01831 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XPCQ01831 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XPCQ01831 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XPCQ01831 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XPCQ01831 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XPCQ01831 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms