Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB1Q01826 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB1Q01826 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms