Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF9Q00978 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF9Q00978 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms