Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSG6Q00889 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSG6Q00889 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms