Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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FAM3AP98173 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FAM3AP98173 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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FAM3AP98173 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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FAM3AP98173 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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FAM3AP98173 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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