Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFI35P80217 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFI35P80217 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFI35P80217 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFI35P80217 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFI35P80217 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFI35P80217 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFI35P80217 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFI35P80217 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFI35P80217 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFI35P80217 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms