Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX6P78412 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX6P78412 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX6P78412 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX6P78412 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX6P78412 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX6P78412 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX6P78412 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX6P78412 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX6P78412 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX6P78412 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX6P78412 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX6P78412 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX6P78412 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX6P78412 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX6P78412 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX6P78412 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms