Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VSNL1P62760 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSNL1P62760 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms