Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA2P62736 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTA2P62736 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTA2P62736 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTA2P62736 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms