Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVS71-1P61550 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVS71-1P61550 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms