Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2D3P61077 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms