Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA6P60900 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMA6P60900 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms