Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PPP4CP60510 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4CP60510 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms