Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCDC1P59894 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCDC1P59894 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms