Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME5P56597 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME5P56597 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NME5P56597 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NME5P56597 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME5P56597 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME5P56597 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NME5P56597 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NME5P56597 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NME5P56597 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms