Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CASP7P55210 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP7P55210 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP7P55210 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP7P55210 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASP7P55210 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASP7P55210 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP7P55210 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP7P55210 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP7P55210 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP7P55210 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP7P55210 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP7P55210 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms