Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCKAP1LP55160 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCKAP1LP55160 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms