Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AQP4P55087 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AQP4P55087 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AQP4P55087 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AQP4P55087 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AQP4P55087 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AQP4P55087 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms