Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRLP54845 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRLP54845 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRLP54845 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRLP54845 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRLP54845 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRLP54845 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRLP54845 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRLP54845 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRLP54845 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NRLP54845 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRLP54845 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRLP54845 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms