Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB3P54284 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms