Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATXN1P54253 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms