Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	VID27	YNL212W	2349 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	TRE2	YOR256C	2430 nt		3.79	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	POL1	YNL102W	4407 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	MEF1	YLR069C	2286 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	KTR6	YPL053C	1341 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	ORC4	YPR162C	1590 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	GIC2	YDR309C	1152 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	BUD25	YER014C-A	462 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SEC53	YFL045C	765 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SDS3	YIL084C	984 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	HYM1	YKL189W	1200 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	ACP1	YKL192C	378 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	PER33	YLR064W	822 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	PSF3	YOL146W	585 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.78	□□□□□ -1.8
DSL1	P53847	PUB1	YNL016W	1362 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RPC11	YDR045C	333 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YOS1	YER074W-A	258 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	FMC1	YIL098C	468 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ALB1	YJL122W	528 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	URA4	YLR420W	1095 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RPS9B	YBR189W	588 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	FLC1	YPL221W	2382 nt		3.77	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	IMD4	YML056C	1575 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	AGA1	YNR044W	2178 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	NAT1	YDL040C	2565 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YBR225W	YBR225W	2703 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	HSP30	YCR021C	999 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	STE14	YDR410C	720 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YJR038C	YJR038C	363 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ANB1	YJR047C	474 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YNK1	YKL067W	462 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YAL065C	YAL065C	387 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RRG9	YNL213C	645 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	SLX1	YBR228W	915 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	FOX2	YKR009C	2703 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RPN4	YDL020C	1596 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	CLG1	YGL215W	1359 nt		3.76	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	AIM14	YGL160W	1713 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	HAP4	YKL109W	1665 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	KRE28	YDR532C	1158 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	TOS8	YGL096W	831 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	GTF1	YGR102C	552 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	AIM23	YJL131C	1071 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RPF2	YKR081C	1035 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	TVP18	YMR071C	504 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RPL15B	YMR121C	615 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YOL162W	YOL162W	648 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	PNO1	YOR145C	825 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	PMS1	YNL082W	2622 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	APN2	YBL019W	1563 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	NTA1	YJR062C	1374 nt		3.75	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	SEC2	YNL272C	2280 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	MEK1	YOR351C	1494 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	HOM2	YDR158W	1098 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	BMH1	YER177W	804 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	IRC25	YLR021W	540 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	GSP1	YLR293C	660 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	PML39	YML107C	1005 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RAD14	YMR201C	1116 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	CPR8	YNR028W	927 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YVC1	YOR087W	2028 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YPR074W-A	YPR074W-A	171 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ARA1	YBR149W	1035 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	PEX34	YCL056C	435 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	PRP22	YER013W	3438 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	NUP85	YJR042W	2235 nt		3.74	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YFL040W	YFL040W	1623 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YGL074C	YGL074C	327 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ERV29	YGR284C	933 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	PCL7	YIL050W	858 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YKL162C	YKL162C	1209 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	MVD1	YNR043W	1191 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RRP7	YCL031C	894 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	SMI1	YGR229C	1518 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	LOS1	YKL205W	3303 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	MDM10	YAL010C	1482 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	PLP1	YDR183W	693 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	SOL3	YHR163W	750 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ARC19	YKL013C	516 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	RIF2	YLR453C	1188 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	YOR131C	YOR131C	657 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	MCM16	YPR046W	546 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ERG5	YMR015C	1617 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DSL1	P53847	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.72	□□□□□ -1.81

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