Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMTNP53814 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMTNP53814 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMTNP53814 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMTNP53814 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMTNP53814 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMTNP53814 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMTNP53814 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMTNP53814 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms