Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms