Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAPOLAP51003 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms