Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RARRES1P49788 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARRES1P49788 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms