Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NESP48681 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NESP48681 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NESP48681 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NESP48681 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NESP48681 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NESP48681 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NESP48681 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NESP48681 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NESP48681 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NESP48681 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NESP48681 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NESP48681 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NESP48681 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NESP48681 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NESP48681 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NESP48681 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NESP48681 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NESP48681 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NESP48681 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NESP48681 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
NESP48681 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NESP48681 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NESP48681 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NESP48681 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NESP48681 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NESP48681 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NESP48681 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NESP48681 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NESP48681 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NESP48681 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NESP48681 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NESP48681 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NESP48681 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NESP48681 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NESP48681 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NESP48681 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NESP48681 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NESP48681 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
NESP48681 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NESP48681 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NESP48681 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NESP48681 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NESP48681 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NESP48681 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NESP48681 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NESP48681 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NESP48681 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NESP48681 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NESP48681 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NESP48681 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NESP48681 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NESP48681 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NESP48681 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms