Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTDSS1P48651 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS1P48651 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms