Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NRIP1P48552 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRIP1P48552 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms